Descontar faltas de asistencia mes seguros sociales

HOla,tengo la siguiente duda. Empresa que me ha pasado una serie de días de faltas de asistencia de un trabajador del mes anterior, lo he descontado en el programa, pero a la hora de hacer el envío de los seguros sociales del mes me lo da como error porque claro esos días de no asistencia al trabajo no se comunicaron, ¿cómo lo puedo hacer y cómo se comunican esos días en Tesorería?.Gracias.

Yo, cotizaría a la seguridad social por la base mínima durante esos días.
Porque sino te tocará hacer recurso y tal por estar fuera de plazo.

Para cotizar por la base mínima hace falta comunicarlo en red en la opción  cambio de contrato grabando el tipo de inactividad 6 , es decir,  como un alta sin remuneración,  no?

Y siendo días completos ¿ por qué no se los descuentas de vacaciones?